Les fonctions usuelles de gestion des documents sont regroupées sous le menu "Fichier".
Un document regroupe et gère les éléments suivants :

 organisation et contenu des idées,
 modèle de structure,
 modèle de style,
 base de références bibliographiques.

Toutes ces informations sont stockées dans un fichier unique (de suffixe *.wit), à l'exception des ressources (images et fichiers HTML) auxquelles le document peut référer (liens). Les informations liées aux modèles de structure et de style, ainsi que les bases de références bibliographiques peuvent être sauvegardées séparément, de manière à être utilisées dans d'autres documents.

Les ressources auxquelles le document se réfère (liens images/fichiers HTML) sont de deux types :

 Ressources directes (définies dans les propriétés des idées) : elles sont automatiquement prises en charge par WIT, et recopiées lors de la génération du site Web.
 Ressources indirectes (spécifiées dans les modèles de structure ou de style ou héritées de pages HTML externes utilisant leurs propres images) : elles sont prises en compte à condition d'avoir été copiées (manuellement) dans un sous répertoire de nom "extra" du répertoire de sauvegarde du document.